Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNDBP1O95273 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms