Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcshO08795 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms