Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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