Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms