Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms