Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cavin4A2AMM0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cavin4A2AMM0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms