Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms