Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms