Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gps1Q99LD4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms