Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClasrpQ8CFC7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms