Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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