Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cntn4Q69Z26 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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