Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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