Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd12Q0VE29 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms