Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms