Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms