Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gdf5P43027 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gdf5P43027 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gdf5P43027 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gdf5P43027 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdf5P43027 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdf5P43027 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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