Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcna1P16388 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcna1P16388 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms