Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms