Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TtrP07309 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TtrP07309 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms