Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm29394H3BIW7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms