Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3173A6NAS3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3173A6NAS3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms