Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms