Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
Nup50Q9JIH2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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