Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms