Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms