Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms