Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ssuh2Q8C3L1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ssuh2Q8C3L1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ssuh2Q8C3L1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ssuh2Q8C3L1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ssuh2Q8C3L1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ssuh2Q8C3L1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ssuh2Q8C3L1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssuh2Q8C3L1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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