Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Foxd1Q61345 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms