Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms