Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RykQ01887 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RykQ01887 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RykQ01887 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RykQ01887 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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