Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms