Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo2P25801 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo2P25801 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo2P25801 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo2P25801 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo2P25801 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo2P25801 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo2P25801 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms