Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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