Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms