Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms