Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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