Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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