Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm10477F6SW83 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms