Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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