Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms