Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms