Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms