Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms