Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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