Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EsrrbQ61539 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms