Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms