Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ascl1Q02067 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms