Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms