Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nucb2P81117 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms